截至2022年8月，欧易生物单细胞事业部在肿瘤领域合作的研究硕果累累，助力客户发表31篇肿瘤领域单细胞文章，平均IF达12.62。

今天，小编带着大家一起回顾7篇欧易单细胞消化系统肿瘤领域的客户文章吧~

 

基于成像质谱技术的肝癌微环境拓扑分析揭示了不同个体发育的巨噬细胞对细胞邻域的反向调节

Topological analysis of hepatocellular carcinoma tumour microenvironment based on imaging mass cytometry reveals cellular neighbourhood regulated reversely by macrophages with different ontogeny

发表期刊：Gut

影响因子：31.793

DOI: 10.1136/gutjnl-2021-324339

文章概述：肝细胞癌 (HCC) 肿瘤微环境 (TME) 是高度复杂的，具有组织成各种功能单元、细胞邻域 (CN) 的多种细胞成分。该研究结果揭示了肝细胞癌肿瘤微环境的各种拓扑功能单元，也提供了大的肝细胞癌病理景观库。这项工作突出了特异性靶向Kupffer细胞而不是阻断髓样细胞整体作为肝细胞癌治疗的新型免疫疗法的潜力。

 

异源Vδ2 γδ T细胞可作为肝细胞癌浸润γδ T细胞功能缺陷的补充

Hepatocellular carcinoma-infiltrating γδ T cells are functionally defected and allogenic Vδ2 γδ T cell can be a promising complement

发表期刊：Clinical and Translational Medicine

影响因子：8.554

DOI: 10.1002/ctm2.800

材料：HCC患者和健康人肝灌洗液

文章概述：该研究通过比较肝细胞癌（HCC）患者和健康人肝灌洗液中的γδ T细胞，发现HCC患者中具有一群独特的γδ T亚群，进一步针对该亚群进行功能富集分析、拟时序分析、细胞周期等分析，发现该亚群LAG3耗竭标记基因以及谷氨酰胺等相关代谢通路显著上调，细胞增殖等相关通路下调，细胞周期停滞在G2/M期。此外，该亚群TCR多样性与克隆型相比健康对照组HCC组明显丢失。研究为未来HCC免疫治疗提供重要的参考。

 

单细胞转录组测序结合多组学解析肝内胆管癌的分子亚群

Molecular Subgroups of Intrahepatic Cholangiocarcinoma Discovered by Single-Cell RNA Sequencing–Assisted Multiomics Analysis

发表期刊：Cancer Immunology Research

影响因子：12.020

DOI: 10.1158/2326-6066.CIR-21-1101

材料：3例ICC样本

文章概述：肝内胆管癌(ICC)是一种相对罕见但高度侵袭性的肿瘤类型，对化疗和免疫治疗反应较差。ICC全面的分子表征对开发新疗法至关重要。研究通过蛋白质组学特征获得了新的ICC肿瘤亚型，并揭示了亚型与预后的关联。

单细胞转录组测序鉴定出一个APOE+C1QB+巨噬细胞亚型，该亚型表现出重塑慢性炎症亚型的能力，并导致ICC的不良预后。此外，研究验证了APOE+C1QB+肿瘤相关巨噬细胞可作为潜在的免疫治疗靶点。

 

单细胞测序助力解析食管鳞状细胞癌分子图谱特征

Dissecting the single-cell transcriptome network underlying esophagus non-malignant tissues and esophageal squamous cell carcinoma

发表期刊：EbioMedicine

影响因子：11.205

DOI: 10.1016/j.ebiom.2021.103459

材料：5个肿瘤组织和5个配对正常组织

文章概述：食管鳞状细胞癌（ESCC）是癌症中恶性和致命的癌症之一，尽管其治疗方面有一定进展，但总体预后的效果仍普遍较差。这种情况的产生与ESCC的高度异质性和肿瘤微环境（TME）密切有关。该研究通过GSVA、拟时序和细胞通讯等分析及实验验证证明了在ESCC肿瘤微环境中多种细胞存在的广泛的重编程过程。这些发现为对ESCC肿瘤微环境和异质性的研究提供了新的参考，并为未来的临床治疗提供了新的潜在治疗靶点。

 

单细胞测序助力解析新辅助化疗手段——紫杉醇+顺铂与单纯手术治疗在食管鳞状细胞癌中的肿瘤微环境差异

Dissecting the single-cell transcriptome network in patients with esophageal squamous cell carcinoma receiving operative paclitaxel plus platinum chemotherapy

发表期刊：Oncogenesis

影响因子：6.524

DOI: 10.1038/s41389-021-00359-2

材料：5例单纯手术治疗肿瘤组织、5例新辅助治疗肿瘤组织

文章概述：食管鳞状细胞癌 (ESCC) 占全世界食管癌病例的90%。虽然新辅助化疗 (NACT-ESCC) 提高了ESCC患者的生存率，但患者的5年生存率仍然较低。该研究通过对ESCC患者术前是否接受NACT治疗的单细胞数据进行比较分析，全面研究了NACT-ESCC和SA-ESCC来源的上皮细胞、基质细胞、免疫细胞的异质性，并探讨了是否接受NACT治疗的肿瘤微环境异质性，发现不同治疗手段细胞组成的多样性及分子复杂性，并提出了ESCC治疗的新靶点，为未来ESCC的治疗提供重要的参考。

 

单细胞和空间转录组分析揭示了FAP成纤维细胞和SPP1巨噬细胞在结直肠癌中的相互作用

Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP fibroblasts and SPP1macrophages in colorectal cancer

发表期刊：Nature Communications

影响因子：17.694

DOI: 10.1038/s41467-022-29366-6

材料：5例非转移性结直肠癌(结肠腺癌，n = 2；直肠癌，n = 3)单细胞转录组测序；4例结直肠癌空间转录组测序

文章概述：结直肠癌(CRC)是常见的恶性肿瘤之一，除手术外，现有治疗手段有限。该研究阐明了CRC中肿瘤细胞类型的潜在来源和调控，发现肿瘤特异性FAP成纤维细胞和SPP1巨噬细胞相互作用，刺激免疫排斥的结缔组织形成，限制T细胞浸润。该研究提供了一种潜在的治疗策略，即通过破坏FAP成纤维细胞和SPP1巨噬细胞的相互作用来改善免疫治疗。

 

一种新的人胆囊癌细胞系ZJU-0430的特性研究

Characteristics of a novel cell line ZJU-0430 established from human gallbladder carcinoma

发表期刊：Cancer cell international

影响因子：6.429

DOI: 10.1186/s12935-019-0911-1

材料：ZJU-0430细胞系

文章概述：胆囊癌（GBC）是胆道常见的恶性肿瘤，占80% - 95%。该研究成功建立了一种名为ZJU-0430的人类GBC细胞系，有助于研究GBC的发病机制以及早期诊断工具和靶向治疗。单细胞转录组测序表明，ZJU-0430主要由具有干性特征的细胞组成，异质性不大。该研究证实了ZJU-0430细胞作为胆囊癌典型模型的潜在应用价值，为胆囊癌发病机制的体内外研究和新的治疗方法的开发提供了依据。

【未完待续】

31篇肿瘤领域单细胞客户文章持续更新中··· ···

长按扫码
咨询欧易生物技术工程师

猜你想看

1、超干货 | 万字长文，揭秘scATAC-seq分析全过程！2、Monocle3单细胞拟时序轨迹方法新升级，还不快来试试？3、四篇植物单细胞高分文章：教你玩转植物单细胞发文新思路！4、Cell Discov | 单细胞转录组测序助力解析圆锥角膜的发病机制

原创声明：本文由欧易生物(OEBIOTECH)学术团队报道，本文著作权归文章作者所有。欢迎个人转发及分享，未经作者的允许禁止转载。