想通过酵母单杂交筛选上游调控因子，该如何选择单杂交诱饵序列呢？选了启动子后，但是启动子上元件很多，如何查询元件功能，选择关键motif？

 

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酵母单杂交诱饵选择方法（Y1HGold-pAbAi系统）

1. 启动子片段形式：选择感兴趣元件比较集中的区域（建议200-300bp左右）；

2. motif形式：选择感兴趣motif进行串联。

注意事项:插入序列中不要同时含有BstbI/BbsI

 

02

常用的启动子预测软件
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/

(Plantcare顺式作用元件预测结果示例）

https://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/?action=newplace

(NEW PLACE顺式作用元件预测结果示例）

 

温馨提示：由于不同建库材料基因表达的时空特异性差异，以及转录因子在总转录水平中的占比较低（约3-5%），推荐所研究的诱饵与建库取材的表达谱相匹配，更有助于通过单杂交技术筛选上游调控因子。

欧易生物提供水稻/拟南芥转录因子家族文库筛选服务。

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