- 01- 背景
免疫组库测序（Immune Repertoire Sequencing，IR-Seq）是一种专用于研究淋巴细胞表面受体多样性的方法。IR-Seq 以T淋巴细胞或B淋巴细胞为研究目标，通过多重 PCR技术特异性扩增 TCR或BCR的多样性决定区（主要是CDR3区），再结合高通量测序技术，全面评估免疫系统的多样性，挖掘免疫组库与疾病的关系。
免疫组库测序技术现已逐渐成为免疫研究的新热点，且已应用到临床诊断、辅助治疗、药物研发、健康体检等多个领域。



图|免疫组库应用领域

-02- 欧易研发
欧易生物与免疫组库研究专家团队密切合作，通过前期大量的实验，现成功设计出人和小鼠TCR和BCR的多重PCR引物，并成功扩增出抗原识别的关键区域CDR3片段；通过高通量测序技术，利用生物信息学方法对高通量测序后的大数据进行分析，成功总结出疾病模型下免疫组学核心算法，相关研究成果已发表在Hepatology（IF=14.079）等高影响因子杂志。
- 03 - 欧易生物免疫组库技术优势
1.针对免疫数据库IMGT包含的TCR和BCR的所有类型设计引物，更全面、准确地检测TCR和BCR的多样性。
2. 技术重现性高，两种T细胞按不同比例混合 1:10，1:100，1:1000，1:10000，测序结果统计与实际比例相一致，可以准确地反应细胞间的比例。 3. 只需要用二代测序短读长平台Hiseq Xten即可完成测序，不需要Miseq或三代测序，极大地降低了成本
4. 人和小鼠的TCRα链、β链、γ链、δ链以及BCR的轻链、重链均能测序分析
5. 针对不同样品（外周血、组织、分选细胞、PBMC）、不同浓度梯度的细胞数均可建库测序
6. 提供从样品准备、建库、测序、分析等一系列全方位服务

- 04 - 免疫组库分析内容  
图 | 免疫组库分析流程
主要分析内容包括：
测序数据评估与过滤；
不同种类V/J基因的数目、频率统计；
不同种类V-J组合和V-D-J组合的数目、频率统计；
V-J组合的重组位点圈图；
V基因、J基因、V-J组合、V-D-J组合的组间差异比较；
CDR3氨基酸克隆型的数目、频率、长度统计；
基于CDR3氨基酸克隆型频率的样本间相似性评估；
CDR3氨基酸克隆型的多样性分析，包括Gini、Simpson、Shannon、Rank Abundance；
CDR3氨基酸克隆型差异表达分析；
样本间共有CDR3氨基酸克隆分析；

- 05 - 部分分析内容展示

 

END

Lisa  撰文

本文系欧易生物原创

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